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重点系统
项目概览
研究软件与分析系统
这里呈现与预测预警、疫情建模、数据工程及文献工作流相关的研究软件、分析管线与支撑系统。
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公开仓库
15
在册项目记录
108
累计 Star
本页首先呈现重点系统，随后依次展开支撑性基础设施、能力框架与实现边界。
研究系统
重点研究系统
支撑上述研究的代表性软件系统与方法组件。
研究代码
MAESTRO
面向呼吸道疾病活动与预警场景的多模态时间序列预测框架；在香港十一年以上流感数据（不含 COVID-19 期间）上报告 R² = 0.956。
连接多模态呼吸道疾病预测、文档化评估与论文产出的研究框架。
ForecastingEarly warningMultimodal modellingTime series
研究代码
ODE-Petri-Chikungunya
面向 2025 年佛山基孔肯雅热疫情的 ODE 与 Petri Net 双模型研究流程，已发表于 BMC Public Health 26 (2026)。
连接机制解释、干预阶段与论文撰写的双模型疫情分析流程。
Mechanistic modellingODEPetri NetOutbreak analysis
研究代码
MultiCoPat
多地区、多时间窗流感共流行分析与预测流程，已发表于 npj Systems Biology and Applications (2026)。
支撑流感共流行与共流行信号相关研究的分析管线。
InfluenzaCo-circulationPredictionTime series
软件
bibverify
面向研究者与 AI 助手的跨平台 BibTeX 校验与元数据补全工具；CLI、Python API、MCP server、可解释多源匹配。已发布到 PyPI。
服务于写作流程的参考文献校验、元数据补全、去重与引用清理工具。
Bibliographic toolingDOI validationMetadata completion
基础设施
工具与支撑性基础设施
支撑性工具与仓库拓展了研究技术栈，但不作为独立的完整演示呈现。
平台
传染病数据平台 / 情报平台
涵盖爬虫、数据库、ETL 与可视化的传染病新闻采集、监测与科研支持平台。含公开与私有代码。
ETLCrawlerDatabaseVisualization
研究代码
布雷图指数预测模型
福建省登革热媒介布雷图指数预测研究的配套代码，已发布为 Research Square 预印本。
Machine LearningPrediction ModelBreteau Index ★ 1
分析项目
2023美赛C题解决方案
2023 年美国大学生数学建模竞赛（MCM）C 题的团队解决方案与代码库。
Mathematical ModelingMCMData Analysis
软件
百度指数爬虫
带图形用户界面的百度指数数据采集爬虫工具。
SpiderData CollectionGUI
软件
研赛 LaTeX 模板
中国研究生数学建模竞赛（华为杯）LaTeX 模板的重构版本。
LaTeXTemplateMathematical Modeling
研究代码
公共卫生数据科学中心疾病数据分地区爬虫
面向公共卫生数据科学中心（phsciencedata.cn）地区与年龄分层疾病数据的爬虫工具。
Public health dataCrawlerRegional surveillanceFujian ★ 5
平台
EPIC 公共卫生信息站点
面向传染病态势感知的 EPIC 公开信息站点静态版本。
Static sitePublic dashboardInfectious disease
软件
openscience 研究工作流
证据优先的研究工作流 harness，含 6 个子套件（science-core / science-compute / science-data / science-epi / science-literature / science-verify），提供阶段门控与追加式 provenance 日志。
Research workflowAI4ScienceCitation verificationMCP
软件
mcodeforlegal 法律工作流
面向中国大陆法律场景的 Claude Code 工作流插件包（合同审查、诉讼支持、合规、公司、劳动、知产），集成法条核查与引用把关。
LegalTechClaude CodeComplianceCross-discipline ★ 1
研究代码
EpicIntel 评测与改进工具集
面向疫情智能体的本地化研究 harness：构建、评测、改进可审计的传染病暴发智能体，遵循确定性公共卫生安全约束（fail-closed 发文、证据绑定、禁止自主审批）。
Agent benchmarkingOutbreak intelligenceDeterministic safetyPublic-health AI
研究代码
汉坦病毒 / 埃博拉研究工作区
可复现、可审计的病毒暴发研究 workspace（汉坦病毒、埃博拉），采用 DVC + Snakemake + MLflow 的 ResearchOps 流程，含数据真实性分级。
ResearchOpsHantavirusEbolaSnakemakeDVC
研究方法概览
研究方法概览
支撑上述研究的方法、系统与产出。
预测预警
多模态预测、预警框架设计、基于分解的工作流与呼吸道疾病信号建模。
机制建模
基于 ODE 与 Petri Net 的疫情分析，面向数据有限条件开展干预导向的结果解释。
数据系统
爬虫管线、ETL、数据库工作流、可视化支持与面向科研的监测基础设施。
科研工具
文献校验、元数据规范化，以及支撑循证写作流程的辅助工具。
动态
近期动态
GitHub 实时动态、重点研究仓库与日常研究技术栈。
重点研究仓库
技术栈
实时活动图
贡献贪吃蛇
3D 贡献档案
指标图集
研究工具链
学术档案
